Prism vám dává možnost uložení projektu do formátů PZF, .PZFX a Compact PZF. Soubor PZF je uložen v binárním formátu a byl primárním formátem až do verze 5 Prism, když byl nahrazen formátem PZFX. Uložení ve formátu PZFX má několik výhod, nicméně existují zprávy o problémech při otevírání souborů PZFX odeslaných prostřednictvím e-mailu, které byly vyřešeny uložením dat Prism ve starším formátu PZF. Současné verze Prism stále podporují formát PZF. Kompaktní formát PZF je další alternativou, protože umožňuje uložit projekt Prism ve formátu PZF, ale bez výsledků anlysis (pro úsporu místa), které bude nutné při otevírání souboru přepočítat.
GraphPad Prism je primárně používán biology, studenty a fyzickými a sociálními vědci na univerzitách, zdravotnických centrech a farmaceutických společnostech po celém světě. Aplikace obsahuje nástroje pro vědecké grafy, nelineární regresní křivku a biostatistiku pro analýzu dat a generování grafů, které mohou být publikovány na webových stránkách, .DOCX files a .PPTX files.