.cram soubor
Typ souboru :Compressed Alignment File
| Vývojář | EBI |
| Kategorie | Datové soubory |
| Formát | Binary |
Co je to soubor CRAM?
Komprimovaný formát souboru pro vyrovnání vytvořený EBI, outstation Evropské laboratoře molekulární biologie; ukládá krátké zarovnání sekvencí DNA vytvořené z alignerů s krátkým čtením, jako jsou BWA, BBMap a BLAT.
Formát souboru CRAM je podobný formátu souboru BAM (Binary Alignment / Map (BAM)). Jak se zvětšují objemy dat v poli genetického softwaru, formát CRAM byl navržen tak, aby se zmenšilo vytištění diskového formátu dat zarovnání.
Zjednodušení krátkého čtení je proces dešifrování, kde sekvence pochází z genomu. To může být obtížné, protože referenční genom je poměrně velký a ne vždy hledáte přesné shody v referenčním genomu. Zkratky s krátkým čtením se používají k vyhledávání enormních sekvencí pro shody a shody. Protože sekvence jsou tak velké, komprese poskytovaná formáty jako CRAM je nezbytná pro udržení spravovatelnosti velikosti souborů.
| Windows |
|